Filosofian periaatteet sisältää koko Descartesin luonnontieteellisen järjestelmän filosofisesta aineellisuuden teoriasta ja hiukkasfysiikasta astronomiaan, geologiaan ja magnetismin teoriaan, inhimillistä aistijärjestelmää unohtamatta. Siinä Descartes niveltää kaiken tietämyksensä yhdeksi kokonaiseksi järjestelmäksi. Teoksen suppeammat kirjoitukset kuvaavat tätä järjestelmää toisenlaisista näkökulmista. Totuuden tutkimus luonnollisella valolla esittelee Descartesin järjestelmän filosofisia perusteita kaunokirjallisin keinoin. Huomautuksia erääseen ohjelmajulistukseen hyökkää Descartesin entistä ystävää Regiusta ja tämän tieteellisiä näkemyksiä vastaan. Kokoelmaan sisältyy myös kirjeitä vuosilta 1641-1645.