Предлагаемое введение в вычислительную эволюционную биологию сочетает два основных подхода в анализе данных о молекулярных последовательностях: изучение взаимного расположения биологических последовательностей в пространстве всех последовательностей и их движения в этом пространстве в процессе эволюции. Соответственно, в первой части книги рассматриваются классические методы анализа последовательностей: парное выравнивание, поиск точного совпадения строк, множественное выравнивание и скрытые марковские модели. В центре внимания второй части находятся задачи молекулярной эволюции: подробно рассматриваются филогенетические деревья, анализ изменчивости последовательностей и динамика генов в популяциях. Кроме того, к учебнику прилагаются компьютерные программы с графическим интерфейсом, что позволяет читателю самому экспериментировать с рядом ключевых описываемых понятий. Книга предназначена для студентов и аспирантов биологических и других специальностей, изучающих...
Predlagaemoe vvedenie v vychislitelnuju evoljutsionnuju biologiju sochetaet dva osnovnykh podkhoda v analize dannykh o molekuljarnykh posledovatelnostjakh: izuchenie vzaimnogo raspolozhenija biologicheskikh posledovatelnostej v prostranstve vsekh posledovatelnostej i ikh dvizhenija v etom prostranstve v protsesse evoljutsii. Sootvetstvenno, v pervoj chasti knigi rassmatrivajutsja klassicheskie metody analiza posledovatelnostej: parnoe vyravnivanie, poisk tochnogo sovpadenija strok, mnozhestvennoe vyravnivanie i skrytye markovskie modeli. V tsentre vnimanija vtoroj chasti nakhodjatsja zadachi molekuljarnoj evoljutsii: podrobno rassmatrivajutsja filogeneticheskie derevja, analiz izmenchivosti posledovatelnostej i dinamika genov v populjatsijakh. Krome togo, k uchebniku prilagajutsja kompjuternye programmy s graficheskim interfejsom, chto pozvoljaet chitatelju samomu eksperimentirovat s rjadom kljuchevykh opisyvaemykh ponjatij. Kniga prednaznachena dlja studentov i aspirantov biologicheskikh i drugikh spetsialnostej, izuchajuschikh...
